海事及水務局在海事及海洋方面的主要職能如下：

• 確保海事安全，監管和控制航海活動；
• 統籌海上搜索和拯救行動以及其他與海事事故有關的工作；
• 防控船舶及有關作業活動對海洋環境的污染損害，執行清理海上垃圾及油污措施；
• 組織履行海域事務管理的合作安排與協議；
• 負責船舶註冊、船員及遊艇駕駛員的登記和管理
• 發出從事海事及港口活動的准照；
• 統籌和管理客運碼頭的運作、監察和跟進港口事務
• 研究和制定便利海運的措施，並促進發展有關業務；
• 促進發展與漁業有關的活動；
• 制定海灘安全規定，監察對該等規定的遵守情況，並向泳客提供援助；
• 提供水文學及海洋學方面的服務；
• 促進和統籌海事人員的培訓，並推廣海事知識；
• 研究和保護海事文化遺產，並促進發展相關活動；
• 負責建造、維修、保養船舶，並檢驗、維修、保養公共實體的車輛。